Hva er forskjellen mellom forsterker og promotor

De hovedforskjell mellom forsterker og promotor er det forsterkeren er DNA-sekvensen til hvilken aktivatorene binder, mens promotoren er DNA-sekvensen som RNA-polymerase og andre basale transkripsjonsfaktorer binder til. Videre er forsterker ansvarlig for å øke transskripsjonshastigheten mens promotoren er ansvarlig for initiering av transkripsjon.

Enhancer og promotor er de to korte DNA-sekvensene som tjener som regulatoriske elementer av et gen. Deres hovedfunksjon er å regulere transkripsjon.

Nøkkelområder dekket

1. Hva er Enhancer
     - Definisjon, Funksjoner, Funksjon
2. Hva er Promoter
     - Definisjon, Funksjoner, Funksjon
3. Hva er Likheter mellom Enhancer og Promoter
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom forsterker og promotor
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelord

Enhancer, Promoter, Transkripsjonshastighet, RNA Polymerase, Transkripsjonsfaktorer, Transkripsjonsinitiering

Hva er Enhancer

En forsterker er et cis-virkende element involvert i å øke aktiviteten til en bestemt promotor. Det er en kort DNA-sekvens på ca. 50-1500 bp, og transkripsjonsfaktorene kalt aktivatorer kan binde seg til det. Plasseringen av forsterkeren kan være opptil 1 Mbp unna promotoren. Det kan også være oppstrøms eller nedstrøms til promotoren. Gjennom beliggenheten er langt borte fra promotoren, er forsterkere romlig nær promotoren, slik at samspillet med RNA-polymerase og basale transkripsjonsfaktorer. Aktivatorene bundet til forsterkerområdet binder deretter med et mediatorkompleks, som i sin tur rekrutterer RNA-polymerasen og de basale transkripsjonsfaktorene til promotorstedet. Orienteringen av forsterkersekvensen har ingen innflytelse på denne virkningen.

Figur 1: Enhancer

Antagonister av forsterkerne er silencers, som kan binde seg til transkripsjonsfaktorene kalt suppressorer. Suppressorer kan nedregulere nivået av transkripsjon.

Hva er Promoter

Promoter er et av de viktigste regulatoriske elementene i genet som initierer transkripsjonen. Den ligger nær genet, oppstrøms til kodonsekvensen. Størrelsen på promotoren kan være 100-1000 bp. De spesifikke DNA-sekvensene kalt responselementer gir initielle bindingssteder for både RNA-polymerase og transkripsjonsfaktorer som rekrutterer RNA-polymerase. RNA-polymerase er enzymet som er ansvarlig for transkripsjonen, polymeriserende komplementære RNA-nukleotider for å syntetisere et mRNA-molekyl.

Figur 2: Promoter

Bakteriell RNA-polymerase assosiert med sigma-faktor kan binde seg til promotoren. Sigma-faktor er en bakteriell transkripsjonsinitieringsfaktor. I eukaryoter må rundt 7 forskjellige basale transkripsjonsfaktorer være bundet til promotoren for å rekruttere RNA-polymerase.

Likheter mellom Enhancer og Promoter

• Enhancer og promotor er to korte DNA-sekvenser som kan forekomme oppstrøms for kodonsekvensen til genet.
• De forekommer i både eukaryoter og prokaryoter.
• Dessuten binder forskjellige typer transkripsjonsfaktorer til begge DNA-sekvensene.
• Videre er hovedfunksjonen til de to DNA-sekvensene å regulere transkripsjon.

Forskjellen mellom Enhancer og Promoter

Definisjon

Enhancer refererer til DNA-sekvensen som øker nivået av transkripsjon av et gen mens promotor refererer til DNA-sekvensen som initierer transkripsjon av et bestemt gen.

plassering

En viktig forskjell mellom forsterkeren og promotoren er at en forsterker kan være plassert oppstrøms eller nedstrøms for genet mens en promotor opptrer oppstrøms for genet i samme kromosom.

Binde til

Videre binder transkripsjonsaktivatorer til forsterkeren mens RNA-polymerase og basale transkripsjonsfaktorer binder til promotoren. Dette er en stor forskjell mellom forsterker og promotor.

rolle

En annen forskjell mellom forsterkeren og promotoren er at forsterkerne er involvert i å øke transskripsjonsnivået mens promotorer er involvert i å kontrollere transkripsjonsstartene.

orientering

Videre er funksjonen til forsterkeren ikke avhengig av orienteringen, mens promotorens funksjon helt avhenger av orienteringen.

Konklusjon

En forsterker er et cis-regulatorisk element som aktivatorer binder for å øke transskripsjonsnivået. Den kan lokaliseres på kort eller lang avstand til genet styrt av forsterkeren. På den annen side er en promoter DNA-sekvensen som RNA-polymerasen binder sammen med de basale transkripsjonsfaktorene. Den ligger nært til genet regulert av promotoren. Hovedforskjellen mellom forsterkeren og promotoren er rollen og plasseringen med hensyn til genet.

Henvisning:

1. "Enhancer (Genetics)." Enhancer-Genetics, ScienceDirect, tilgjengelig her
2. "Promoters." Addgene, tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "Figur 16 04 01" Av CNX OpenStax - (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "Reportergen" (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia