Forskjellen mellom genetisk kart og fysisk kart

De nøkkelforskjell mellom genetisk kart og fysisk kart er i teknikkene som brukes i genomkartlegging. Ved generering av et genetisk kart, brukes genetiske markører og genetiske loci til å studere genkoblingsmønstrene, mens fysisk kartlegging bruker molekylærbiologiteknikker som RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) og Hybridiseringsteknikker.

Genetiske kart og fysiske kart to typer kart som konstruerer for å vise gene som ligger i kromosomer. De involverer i genetisk diagnostikk og å forutsi evolusjon angående genomanalyse. Videre bruker de å analysere avstandene mellom genloci og å analysere genpolymorfismer.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er genetisk kart
3. Hva er fysisk kart
4. Likheter mellom genetisk kart og fysisk kart
5. Side ved side-sammenligning - Genetisk kart vs fysisk kart i tabellform
6. Sammendrag

Hva er genetisk kart?

Et genetisk kartbase på genlokaliseringene og genetiske markører identifisert ved koblingsanalyse og genassosiestudier. Mendelsk genetikk forklarer de genetiske kartene og Gregor Mendel er personen som introduserte dette konseptet. Et genetisk kart er nyttig for å studere kromosomstedene og gene som er involvert i å gi opphav til spesielle egenskaper. Disse genene arvet av dattergenerasjonene blir deretter identifisert som genetiske markører for en bestemt sykdom eller karakter.

Figur 01: Genetisk kart

Flere avlsteknikker over mange generasjoner, og deretter analysere avlsmønstrene for en bestemt egenskap eller karakteristikk, er nødvendige før konstruksjon av et genetisk kart. Og også genforeningstudier støtter videre identifisering av forskjellige alleler som er ansvarlige for spesifikke arvsmønstre i genetisk kartlegging. Allelfrekvensene og genfrekvensene bidrar til å forutsi genkartet til et bestemt gen på et kromosom.

Hva er fysisk kart?

Fysiske kart av gener konstruerer ved hjelp av molekylærbiologiske teknikker som restriktionsenzym fordøyelse, etc. Derfor, restriksjonskart er et annet navn for dette kartet. Ved generering av et fysisk kart, skjærer restriksjonsenzymer i begynnelsen DNAene i fragmenter. Disse fragmentene separeres deretter ved gelelektroforese. Neste trinn er genereringen av det fysiske kartet av DNA. Som et ytterligere trinn kan de bli utsatt for blottingsteknikker etter hybridiseringen. I dag brukes høye gjennomstrømningsmetoder som Fluorescence In situ-hybridisering ved å generere fysiske kart for bruk som genetiske markører.

Figur 02: Fysisk kart

Fysiske kart er mer nøyaktige og raske med sammenligning med genetiske kart. Derfor er deres bruk i analysering av genpolymorfisme høy i sammenligning med genetiske kart. Fysisk kartlegging anser ikke Mendeliske genetiske mønstre også.

Hva er likhetene mellom genetisk kart og fysisk kart?

  • Begge kartene involverer å karakterisere genetiske markører.
  • Gjennomsøkende studier utnytter begge kartene.
  • Genetisk kart og fysisk kart er nyttige i genetisk diagnostikk.

Hva er forskjellen mellom genetisk kart og fysisk kart?

Genetisk kart er et genkart basert på genkoblingene og genassosjonsstudiene gjort på en genetisk markør eller genloci av et kromosom. Fysisk kart er et genkart der genkartet fysisk er avledet ved å isolere DNA og oppnå den nøyaktige genetiske markøren ved hjelp av molekylærbiologi teknikker. Med hensyn til teknikkene som brukes i disse to kartene, er forskjellen mellom genetisk kart og fysisk kart at det genetiske kartet bruker genkoblings- og genassosjonsanalysemetoder mens fysisk kart bruker restriksjonskartlegging og hybridiseringsteknikker. Derfor er nøyaktigheten i genetisk kart lavt mens den er høy i fysisk kart.

Når man sammenligner hurtigheten i teknikkene som brukes i disse to kartene, har det genetiske kartet mindre raske og tidskrevende teknikker. Imidlertid har fysisk kart svært raske teknikker. Følgelig er genetisk kart mindre effektivt, mens det fysiske kartet er svært effektivt. Videre er genetiske kart basert på Mendelske arvsmønstre, mens fysiske kart ikke er direkte på Mendelske arvsmønstre.

Oppsummering - Genetisk kart vs fysisk kart

Genomstudier bruker genetiske markører plassert i kromosomene. For å studere disse markørene må de kartlegges ved hjelp av forskjellige teknikker. Mendelisk genetikk er grunnlaget for genetiske kart. Under den genetiske kartleggingen studeres forskjellige egenskaper i mange generasjoner, og genene analyseres ved hjelp av genkoblinger og genassosiestudier. I motsetning innbefatter fysiske genkart fysisk isolering og karakterisering av genetiske markører ved å trekke den ut. Dette er hovedforskjellen mellom genetisk kart og fysisk kart.

Henvisning:

1.O'Rourke, Jamie A. "Genetisk og fysisk kartkorrelasjon." Encyclopedia of Life Sciences, nov. 2014. Tilgjengelig her   
2. "Genetic Mapping Fact Sheet." National Human Genome Research Institute (NHGRI). Tilgjengelig her 

Bilde Courtesy:

1.File: NHGRI Faktaark - Genetisk Kartlegging (27058469495) 'Av National Human Genome Research Institute (NHGRI) fra Bethesda, MD, USA - NHGRI Faktaark: Genetisk kartlegging, (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia 
2.'Human kromosom Y - 400 550 850 bphs'By Nasjonalt senter for bioteknologisk informasjon, U.S. National Library of Medicine (Public Domain) via Commons Wikimedia