Forskjellen mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer

Nøkkelforskjell - Generelt vs spesifikke transkripsjonsfaktorer
 

Transkripsjonsfaktorer kreves ved RNA-polymerase for å virke på DNA-templatstrengen ved syntetisering av mRNA. Det finnes forskjellige typer transkripsjonsfaktorer. Disse transkripsjonsfaktorene danner et kompleks med DNA-strengen. De endrer enten bekreftelsen på malstrengen eller øker affiniteten til RNA-polymerasenzymet mot mRNA-syntese i prosessen med kalt transkripsjon. Det er to hovedtyper av transkripsjonsfaktorer. De er generelle eller basale transkripsjonsfaktorer og de spesifikke transkripsjonsfaktorene. De generelle transkripsjonsfaktorene er de faktorene som brukes til å danne pre-initieringskomplekset under transkripsjonsprosessen. De er tilstede i nesten alle eukaryoter, og i prokaryoter danner de et mindre komplisert kompleks. De spesifikke transkripsjonsfaktorene er enten forsterkere eller repressorer, som er spesifikke DNA-sekvenser som aktiverer eller undertrykker den generelle transkripsjonsprosessen. Noen spesifikke transkripsjonsfaktorer kan endre selve DNA-sekvensen. De nøkkelforskjell mellom de generelle transkripsjonsfaktorene og de spesifikke transkripsjonsfaktorene er basert på funksjonaliteten. Generelle transkripsjonsfaktorer er involvert i dannelsen av et pre-initieringskompleks av transkripsjonsprosessen, mens spesifikke transkripsjonsfaktorer deltar i enten aktivering eller undertrykkelse av transkripsjonsprosessen.

INNHOLD

1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er generelle transkripsjonsfaktorer
3. Hva er spesifikke transkripsjonsfaktorer
4. Likheter mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer
5. Side ved side-sammenligning - Generelt mot spesifikke transkripsjonsfaktorer i tabellform
6. Sammendrag

Hva er generelle transkripsjonsfaktorer?

Generelt eller Basal transkripsjonsfaktorer er faktorene som er involvert i dannelsen av initieringskomplekset under transkripsjon. De er essensielle for transkripsjonsprosessen, derfor spiller de en viktig rolle i den vellykkede transkripsjonen. Det er seks hoved generelle transkripsjonsfaktorer. De er; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF og TFIIA. De spiller forskjellige roller under dannelsen av initieringskomplekset.

1. TFIID - Denne transkripsjonsfaktoren (TF) er involvert i å gjenkjenne promotorsekvensen (TATA-boksen).
2. TFIIB - Promotor / TFIID-komplekset er anerkjent av TFIIB. Dette gir et signal for bindingen av den viktigste katalyserende enzym-RNA-polymerase.
3. TFIIF - Denne transkripsjonsfaktoren er bundet til RNA-polymerasen. TFIIF deltar således i prosessen ved å rekruttere RNA-polymerasen til riktig sted.
4. TFIIE og TFIIH - Bindingen av disse transkripsjonsfaktorene markerer slutten av dannelsen av pre-initiering. Binding av disse øker effektiviteten av dannelsen av pre-initieringskomplekset.
5. TFIIA fremmer bindingen av TFIID til TATA-boksen.

Figur 01: Generelle transkripsjonsfaktorer

De ovenfor nevnte generelle transkripsjonsfaktorer er spesifikke for RNA-polymerase II, som er typen RNA-polymerase som forlenger mRNA-strengen. Det er generelle transkripsjonsfaktorer involvert med RNA-polymerase I og III. Generelle transkripsjonsfaktorer kan også variere i henhold til typen celle som den virker på.

Hva er spesifikke transkripsjonsfaktorer?

Spesifikke transkripsjonsfaktorer er regioner som også ligger i DNA-sekvensene. De er for det meste enten forsterkere eller repressorer. Spesifikke transkripsjonsfaktorer er de spesifikke cis-virkende elementene i mal-DNA-strengen som gjennomgår transkripsjon. Aktivering av disse spesifikke forsterkere og repressorer deltar i å øke enzymets affinitet ved å endre orienteringen av DNA-molekylet eller ved å fungere som signalområder. Spesifikke transkripsjonsfaktorer benyttes også til å indusere modifikasjoner på DNA-templatstrengen. Disse modifikasjonene involverer hovedsakelig kovalente modifikasjoner som metylering. Dermed virker metylerte DNA-regioner som spesielle forsterkere eller repressorer av transkripsjonsprosessen.

Figur 02: Spesifikke transkripsjonsfaktorer

De spesifikke Transkripsjonsfaktorene avhenger av typen av arter og er ikke vanlig funnet i alle eukaryoter. Disse transkripsjonsfaktorene aktiveres ved forskjellige metabolske forhold via signaltransduksjonsveier. Ved aktivering regulerer de ekspresjonen av genet på et transkripsjonsnivå.

Hva er likhetene mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer?

• Begge faktorene kreves i transkripsjonsprosessen.
• Begge faktorene påvirker genuttrykket av en organisme.
• Begge faktorer bidrar til å regulere funksjonen av RNA-polymerase i transkripsjonsprosessen.
• Begge faktorene finnes hovedsakelig i eukaryoter.

Hva er forskjellen mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer?

Generelt mot spesifikk transkripsjon
De generelle transkripsjonsfaktorene er de faktorene som brukes til å danne pre-initieringskomplekset under transkripsjonsprosessen.	De spesifikke transkripsjonsfaktorene er enten forsterkere eller repressorer, som er spesifikke DNA-sekvenser som aktiverer eller undertrykker generell transkripsjonsprosess.
Type Molekyl
Generelle transkripsjonsfaktorer er proteinbaserte.	Spesifikke transkripsjonsfaktorer er nukleotidsekvenser.
dannelse
Generelle transkripsjonsfaktorer danner pre-initieringskomplekset under transkripsjonsinitieringen.	Spesifikke transkripsjonsfaktorer virker som forsterkere eller repressorer av transkripsjon.
typer
Det er seks hovedtyper; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE og TFIIA av generelle transkripsjonsfaktorer.	Spesifikke transkripsjonsfaktorer er hovedsakelig kategorisert som forsterkere og repressorer.

Sammendrag - Generelt vs spesifikke transkripsjonsfaktorer

Transkripsjonsfaktorer er avgjørende for transkripsjonsreguleringen og kreves for økt effektivitet og nøyaktighet av prosessen. Transkripsjonsfaktorer er to hovedtyper; Generelt / Basal og spesifikk. Generelle transkripsjonsfaktorer er involvert i dannelsen av pre-initieringskomplekset under transkripsjon, mens spesifikke transkripsjonsfaktorer er regioner i selve DNA som virker som forsterkere eller repressorer. Generelle transkripsjonsfaktorer er proteinbasert og kreves av alle eukaryoter. Det er ikke variert mye og forblir som ensartede molekyler. En bestemt transkripsjonsfaktor kan variere mye og avhenger av individens genetiske sminke. Dette er forskjellen mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer.

Last ned PDF-versjonen av General vs spesifikke transkripsjonsfaktorer

Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til off-line formål som per sitatnotat. Vennligst last ned PDF-versjonen her Forskjellen mellom generelle og spesifikke transkripsjonsfaktorer

Henvisning:

1.Pulverer, Bernd. "Sekvens-spesifikke DNA-bindende transkripsjonsfaktorer." Nature News, Nature Publishing Group. Tilgjengelig her 
2. "Transkripsjonsfaktorer - Genspesifikke Faktorer Differensielt Forbedre Transkripsjonsrenter." DNA, Bind, Promoter, og Bind - JRank Artikler. Tilgjengelig her  
3.Orphanides, G, et al. "De generelle transkripsjonsfaktorene for RNA-polymerase II." Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. Tilgjengelig her  

Bilde Courtesy:

1.'Preinitiasjonskompleks 'Av ArneLH - Egentlig arbeid, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia  
2.'Role av transkripsjonsfaktor i genuttrykksregulering 'Av Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational Systems Biology of Cancer Chapman & Hall / CRC Matematisk & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia