Forskjellen mellom RNASE A og RNASE H
Share
Nøkkelforskjell - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleaser er nukleaser som spesifikt degraderer RNA i mindre enheter. De kan deles inn i to kategorier; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuklease er en endonuklease som enten kan nedbryte enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Det klipper fosfodiesterbindingene i en RNA-polynukleotidkjede. Eksemplene er RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P og RNase H. Exoribonuklease er en exonuklease som nedbrytes RNA ved å fjerne terminale nukleotider fra enten 5'end eller 3'end av RNA-molekylet. Eksemplene er RNase R, RNase II, RNase D og RNase PH. De nøkkelforskjell mellom RNASE A og RNASE H er at RNase A er en bukspyttkjertel ribonuklease som spesifikt nedbryter enkeltstrenget RNA til mindre komponenter mens RNase H er et ikke-spesifikt enzym som spalter RNA i RNA-DNA-hybrid i mindre enheter via hydrolytisk mekanisme.
INNHOLD
1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er RNASE A
3. Hva er RNASE H
4. Likheter mellom RNASE A og RNASE H
5. Side ved side-sammenligning - RNASE A vs RNASE H i tabellform
6. Sammendrag
Hva er RNASE A?
RNase A er en bukspyttkjertel ribonuklease som spesifikt spalter de uparbeide cytosin- og uracilrester ved 3'-enden av enkeltstrenget RNA. RNase H virker ved en høyere saltkonsentrasjon (0,3M eller høyere NaCl-konsentrasjon). Den hydrolytiske reaksjonen er to trinn. Den danner et 3'-fosforylert produkt via 2 ', 3'-cyklisk monofosfat-mellomprodukt. Selv om det er spesifikt for enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon, kan den også nedbryte dobbeltstrenget RNA og RNA i RNA-DNA-hybrid ved lavere NaCl-konsentrasjon (lavere enn 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield syntetiserte først dette enzymet. RNase A er et svært populært enzym i molekylær forskning. Bovin pankreas RNase A er et eksempel på RNase A. Og det er et av de hardeste enzymene som brukes i laboratoriet. Dette enzymet trenger ikke en koaktor for sin aktivitet. Det er et svært termostabilt enzym. RNase A er det første enzymet og det tredje proteinet som en korrekt aminosyresekvens ble påvist. Dette enzymet er svært lite med 124 aminosyrer og molekylvekt på 12600da. Og den har fire histidinrester (His 12 og His 119 som involverer i katalytisk reaksjon).
Figur 01: RNase A
RNase A kan isoleres ved å koke en rå prøve. Når kokes, nedbryter alle andre enzymer resterende RNase A. RNase A er et utrolig stabilt enzym. Dette enzymet hemmer ribonukleaseinhibitorprotein, tungmetall og uridin vanadatkomplekser.
Hva er RNase H?
RNase H er et ikke-spesifikt ribonuklease-enzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaksjon. RNase H spalter 3'-O-P-bindingen til RNA i en RNA-DNA-hybrid. Til slutt produserer det 3'OH og 5 'fosfat terminerte produkter. I DNA-replikasjon spiller den en sentral rolle ved å fjerne RNA-primer etter at nye DNA-tråder er dannet. I laboratoriebetingelser nedbrytes det spesifikt RNA i RNA-DNA-hybrid, men ikke DNA og ikke-hybridisert RNA. Og dette enzymet brukes vanligvis til å ødelegge RNA-malen etter at første komplementære DNA-streng er dannet under cDNA-syntese.
Figur 02: RNase H
RNase H bruker også i nukleasebeskyttelsesanalyser. Det kan også inkorporeres i fjerning av poly A-hale fra mRNA. RNase H har evnen til å ødelegge det ikke-kodende RNA i og utenfor cellen. Metallionene kreves som koaktorer for denne proteinaktiviteten. En chelator (EDTA) kan brukes til å hemme RNase H enzymet.
Hva er likhetene mellom RNASE A og RNASE H?
- Begge er protein i naturen.
- Begge er endoribonuklease
- Begge kan nedbryte RNA.
- Begge utfører hydrolytiske reaksjoner.
- Molekylære laboratorier bruker begge disse.
Hva er forskjellen mellom RNASE A og RNASE H?
RNASE A vs RNASE H | |
| RNase A er en bukspyttkjertel ribonuklease som spesifikt spalter 3'-enden av uparbert cytosin og uracilrester av enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon. | RNase H er et ikke-spesifikt ribonuklease enzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA hybrid via hydrolytisk reaksjon. |
| Naturen av RNA Cleaving | |
| RNase A spalter spesifikt enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon. | RNase H spalter RNA i RNA-DNA-hybrid. |
| Behov for samfaktorer for aktivitet | |
| RNase A trenger ikke kofaktorer for sin aktivitet. | RNase H trenger metallioner som koaktorer for sin aktivitet. |
| Inhibitorer av proteinaktivitet | |
| Ribonukleaseinhibitorprotein, tungmetall og uridin vanadatkomplekser hemmer RNAse A-aktiviteten. | En chelator (EDTA) hemmer RNase H-aktivitet. |
| RNA-primerfjerning i DNA-replikasjon | |
| RNase A brukes ikke for RNA-primerfjerning i DNA-replikasjon. | RNase H brukes til RNA-primerfjerning i DNA-replikasjon |
| DNA-malfjerning i komplementær DNA (C-DNA) -syntese | |
| RNase A brukes ikke for RNA-malfjerning under komplementær DNA-syntese (C-DNA). | RNase H brukes for RNA-malfjerning under komplementær DNA-syntese (C-DNA). |
| Fjerning av Poly-A-Tail i mRNA Hybridisert til Oligo (dt) | |
| RNase A brukes ikke til å fjerne "poly-A tail" i mRNA hybridisert til oligo (dt). | RNase H brukes til å fjerne "poly-A tail" i mRNA hybridisert til oligo (dt) |
Sammendrag - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleaser er nuklease-enzymer som har evne til å spalte RNA i mindre enheter. De er to typer; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuklease er en endonuklease som har evne til å nedbryte enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Og det klipper fosfodiesterbindingen i en RNA-polynukleotidkjede. RNase A og RNase H er to endoribonukleaser. RNase A er en bukspyttkjertel ribonuklease som spesifikt spalter uparbert cytosin og uracilrester ved 3'-enden av det enkeltstrengede RNA ved høyere saltkonsentrasjon. RNase H er et ikke-spesifikt ribonuklease enzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA hybrid via hydrolytisk reaksjon. Dette er forskjellen mellom RNase A og RNase H.
Last ned PDF RNASE A vs RNASE H
Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til off-line formål som per sitatnotat. Vennligst last ned PDF-versjon her Forskjellen mellom RNASE A og RNASE H
Henvisning:
1.Karuturi, Forfatter Amrutha. "17 trenger å vite fakta om RNase A." AG Blog, 22. februar 2017. Tilgjengelig her
2. "Ribonuclease." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. januar 2018. Tilgjengelig her
Bilde Courtesy:
1.'RNase A'By Ingen maskinlesbar forfatter gitt. Vossman antok (basert på opphavsrettskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Ingen maskinlesbar forfatter gitt. Vossman antok (basert på opphavsrettskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
