Forskjellen mellom Ti og Ri plasmid
Share
Hovedforskjell - Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium arter er plantepatogener som fremkaller ulike sykdommer i høyere planter. Ti (tumor-inducerende) og Ri (rot-inducerende) plasmider er to typer naturlige plasmider produsert av Agrobacterium arter. Ti plasmider er produsert av Agrobacterium tumefaciens mens Ri-plasmider er produsert av Agrobacterium rhizogenes. Både Ti og Ri plasmider består av en del av plasmid-DNAet kjent som T-DNA som overføres til plantegenomet ved hjelp av virulens (vir) -gener. De hovedforskjell mellom Ti og Ri plasmid er det Ti Plasmid induserer tumor / krone gall i dicots mens Ri plasmid induserer hårete røtter. På grunn av deres evne til å infisere planter, blir både Ti og Ri plasmider mye brukt som vektorer for å produsere transgene planter.
Nøkkelområder dekket
1. Hva er Ti Plasmid
- Definisjon, struktur, vektorproduksjon
2. Hva er Ri Plasmid
- Definisjon, struktur, vektorformasjon
3. Hva er likhetene mellom Ti og Ri plasmid
- Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom Ti og Ri plasmid
- Sammenligning av nøkkelforskjeller
Nøkkelbetingelser: Agrobacterium Arter, Genetisk Engineering, Hårete Røtter, Ri Plasmid (PRI), T-DNA, Ti-plasmid (PTI), Tumor, for gener
Hva er Ti Plasmid
Ti plasmid refererer til en type plasmid av det tillater Agrobacterium tumefaciens å infisere planter, produsere en svulst / krone galle svulst. Ti-plasmidet består således av både tumordannelse og virulens (vir) gener. De vir gener er ansvarlig for overføringen av T-DNA som inneholder de tumordannende gener i plantegenomet ved excision og integrasjon. En typisk Ti-plasmid består av fire regioner: region A (T-DNA som er ansvarlig for tumordannelse), region B (ansvarlig for replikasjon), region C (ansvarlig for konjugasjon) og region D (ansvarlig for virulens). Generene i T-DNA-regionen styrer produksjonen av planteveksthormoner (auxin og agropin), som induserer spredning av de infiserte planteceller. Begge ender av T-DNA-regionen flankeres av en grensesekvens som inneholder direkte sekvensrepetater av 24 basepar. Bare den rette grensen er uunnværlig for T-DNA-overføring. Strukturen av Ti plasmid er vist i Figur 1.
Figur 1: Ti-plasmid
I Agrobacterium-mediert transformasjon av gener, vektoren er utformet basert på Ti-Plasmid. Vektoren er sammensatt av T-DNA-grensesekvenser, vir gener og den modifiserte T-DNA-regionen. Under modifikasjonen av T-DNA-regionen fjernes generene som er ansvarlige for tumordannelsen og erstattes av de fremmede gener som skal transformeres.
Hva er Ri Plasmid
Ri-plasmid refererer til en type plasmid som tillater det Agrobacterium rhizogenes å smitte buksceller ved å produsere hårete røtter. Den består av to T-DNA-fragmenter kjent som Tr-DNA og T1-DNA. Begge fragmentene separeres av et 15 kb DNA-segment. Tr-DNA er lik T-DNA-regionen til Ti-plasmidet og inneholder gener som induserer produksjon av veksthormoner. T1-DNA-regionen består av fire gener: Rola (ansvarlig for dannelsen av hårete røtter), rolB (induserer rotinitiering og kallusdannelse), rolC (fremmer rotvekst), og Rold (undertrykker callus vekst). Transformasjonen av T-DNA er indusert av vir gener. Dannelsen av hårete røtter av Agrobacterium rhizogenes er vist i figur 2.
Figur 2: Hårete røtter
Ti plasmider erstattes for det meste av Ri plasmider i genteknologi.
Likheter mellom Ti og Ri Plasmid
- Ti og Ri plasmider produseres naturlig av Agrobacterium.
- Begge typer plasmider forårsaker sykdommer i mange dikotyledonøse planter.
- Både Ti og Ri plasmider overfører en del av plasmid-DNAet kjent som T-DNA i plantegenomet ved hjelp av virulens (vir) gener.
- Størrelsen på både Ti og Ri plasmider er rundt 200 kb.
- Regulatoriske sekvenser av noen gener funnet i T-DNA fra begge plasmidene er anerkjent av plantecellemekanismer.
- De andre gener i T-DNA består av prokaryotiske regulatoriske sekvenser.
- På grunn av evnen til å infisere planteceller, brukes både Ti og Ri plasmider i genteknologi for å produsere transgene planter.
Forskjellen mellom Ti og Ri plasmid
Definisjon
Ti plasmid: Ti plasmid er en type plasmid av det som tillater bakteriene å infisere planter, som produserer en tumor / krone galle svulst.
Ri-plasmid: Ri-plasmid er en type plasmid som tillater bakterier å infisere planteceller ved å produsere hårete røtter.
Type av Agrobacterium arter
Ti plasmid: Ti plasmid er produsert av Agrobacterium tumefaciens.
Ri-plasmid: Ri plasmid er produsert av Agrobacterium rhizogenes.
Størrelse
Ti plasmid: Størrelsen på Ti-plasmidet er 180-205 kb.
Ri-plasmid: Størrelsen på Ri-plasmidet er 250 kb.
Type sykdom
Ti plasmid: Ti plasmid induserer dannelsen av kronegal / tumor.
Ri-plasmid: Ri plasmid induserer dannelsen av hårete røtter.
Type studie
Ti plasmid: Ti plasmider er mindre studert i forhold til Ri plasmider.
Ri-plasmid: Ri plasmider er godt undersøkt.
Konklusjon
Ti plasmid og Ri plasmid er to typer plasmider funnet i forskjellige Agrobacterium arter. Både Ti-plasmidene og Ri-plasmidene består av T-DNA og vir gener. Ti plasmider finnes i Agrobacterium tumefaciens som induserer dannelsen av kronegalltumor. Ri plasmider finnes i Agrobacterium rhizogenes som fremkaller dannelsen av hårete røtter. Hovedforskjellen mellom Ti og Ri plasmid er typen sykdom forårsaket av hver type plasmid.
Henvisning:
1. "Forelesning 26: Ti og Ri-plasmider." NPTEL, IIT Guwahati, Tilgjengelig her.
2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Agrobacterium rhizhogenes og Ri Plasmid." Tilgjengelig her.
Bilde Courtesy:
1. "Ti plasmid" Av Mouagip - Eget arbeid (CC0) via Commons Wikimedia
2. "Agrobacterium rhogenogenes" Av FruitDefendu - Eget arbeid (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
