Hva er forskjellen mellom mikrosatellitt og minisatellitt

De hovedforskjell mellom mikrosatellitt og minisatellitt er det den repeaterende enheten til en mikrosatellitt består av 2-6 basepar, mens den gjentatte enheten i en minisatellitt består av 10-100 basepar. Videre inneholder en mikrosatellitt-array 5-200 gjentagelser, mens en minisatellitt-serie inneholder 10-1.500 gjentagelser.

Mikrosatellitt og minisatellitt er to typer repeterende DNA i genomet. Hovedbruken av mikrosatellitt-DNA er for DNA-fingeravtrykk, mens minisatellites er for faderskapstesting som de forekommer i familiegrupper.

Nøkkelområder dekket

1. Hva er Microsatellite
     - Definisjon, struktur, betydning
2. Hva er Minisatellite
     - Definisjon, struktur, betydning
3. Hva er likhetene mellom mikrosatellitt og minisatellitt
     - Oversikt over vanlige funksjoner
4. Hva er forskjellen mellom mikrosatellitt og minisatellitt
     - Sammenligning av nøkkelforskjeller

Nøkkelord

DNA Fingeravtrykk, Mikrosatellitt, Minisatellitt, Faderskapstesting, Repeterende DNA

Hva er Microsatellite

En mikrosatellitt er en repeterende sekvens av 2-6 basepar i genomet. Siden det er en type tandem gjentakelser med korte sekvenser av nukleotider, er mikrosatellitter også kjent som korte tandem gjentakelser (STRs). Repetisjonene av enkelt nukleotider kalles enkelt nukleotidpolymorfisme (SNP). Videre forekommer mikrosatellitter gjennom genomet. I det menneskelige genomet opptrer duukleotidrepetisjonene i hver 30 000 basepar.

Figur 1: Faderskapsanalyse

Videre er mikrosatellitter en svært mutativ region i genomet. Den viktigste metoden for å anskaffe mutasjoner er gjennom DNA-slipp under replikering. Unike mikrosatellitt-sekvenser forekommer i familier. Derfor bruker vi analysen av mikrosatellitter for faderskapstesting. Videre forårsaker forlengelsen av trinucleotidmikrosatellittrepetater alvorlige humane lidelser som Fragile X syndrom og Huntingtons sykdom.

Hva er en Minisatellite

Minisatellitt er en repeterende sekvens av 10-100 basepar i genomet. Her er den gjentatte enheten noe stor og den kalles a DNA-motiv. Et annet navn for minisatellitt er variabel antall tandem gjentakelser (VNTRs). Antallet VNTR er svært variabelt blant enkeltpersoner. Den repeterende enheten til en minisatellitt er GC-rik.

Figur 2: Minisatellites

På grunn av minisatellites svært varierende karakter blant enkeltpersoner, bruker forskere dem til DNA fingeravtrykk. De bruker også minisatellitter som genetiske markører under koblingsanalysen. Noen minisatellitt-sekvenser er involvert i dannelsen av ras onkogenassosiert kreft.

Likheter mellom mikrosatellitt og minisatellitt

• Mikrosatellitt og minisatellitt er to typer svært repeterende DNA som består av tandem-gjentagelser i det eukaryote genomet.
• Selv om de ikke har noen tilordnet funksjon i genomet, er de viktige for å opprettholde strukturen av genomet.
• Dessuten forekommer disse DNA-sekvensene ikke i de intergeniske områdene. Derfor er de ikke-kodende DNA.
• Videre kan begge av dem brukes til identifikasjon av enkeltpersoner.
• Noen av dem kan være forbundet med sykdommer.
• De vises som små, mørke bånd i CsCl densitetsgradientanalyse.

Forskjellen mellom mikrosatellitt og minisatellitt

Definisjon

Mikrosatellitt refererer til et sett med korte, gjentatte DNA-sekvenser på et bestemt sted på et kromosom, som varierer i antall hos forskjellige individer, og kan derfor brukes til genetisk fingeravtrykk, mens minisatellitt refererer til en form for polymorf DNA, omfattende et varierende antall tandem-gjentakelser , med repeterende enheter på opptil 100 nukleotider i lengde. Dette er den grunnleggende forskjellen mellom mikrosatellitt og minisatellitt.

Type Tandem Gjentakelser

Mikrosatellitter er STR mens minisatellitter er VNTRs.

Hendelse

I tillegg forekommer mikrosatellitter hovedsakelig gjennom genomet mens minisatellitter hovedsakelig forekommer i endenes ender.

Størrelse på repeteringsenheten

Størrelsen på den gjentatte enheten av en mikrosatellitt er 2-6 basepar, mens størrelsen på den gjentatte enheten av en minisatellitt er 10-100 basepar. Dette er en stor forskjell mellom mikrosatellitt og minisatellitt.

Antall gjentakelser per genom

En bestemt gjentakende enhet oppstår ca. 5-200 ganger i genomet i mikrosatellitter mens en bestemt gjentakende enhet opptrer 10-1.500 ganger i minisatellitter.

Størrelsen på Array

En annen forskjell mellom mikrosatellitt og minisatellitt er at størrelsen på gruppen av gjentatte enheter er 10-1000 basepar i mikrosatellitter, mens størrelsen på arrayet av gjentagende enheter er 0,5-15 kb i mikrosatellitter. 

Kompleksitet av Array

Utvalget av mikrosatellitter er hovedsakelig homogen, mens gruppen av minisatellitter er heterogen.

Konklusjon

Mikrosatellitt er en type repeterende DNA i det eukaryote genomet med 2-6 basepar lange repeterende sekvenser. De er utbredt gjennom genomet og kan brukes til faderskapstesting. På den annen side er minisatellitt en type repeterende DNA med 10-100 basepar lange repeterende sekvenser. De forekommer hovedsakelig på slutten av kromosomene og kan brukes til DNA fingeravtrykk. Dermed er hovedforskjellen mellom mikrosatellitt og minisatellitt deres struktur og betydning.

Henvisning:

1. Ramel, C. "Mini- og Microsatellites." Miljøhelseperspektiv105.Suppl 4 (1997): 781-789. Tilgjengelig her

Bilde Courtesy:

1. "Stages of Gene Fingerprinting" Av Sneptunebear16 - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia  
2. "VNTRexample" Av Madelyndotson - Eget arbeid (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia